Jusqu’aux années 1990, le Japon était le pays développé qui approuvait le plus les demandes arabes de boycott d’Israël. En conséquence, les relations économiques ont été très limitées pendant la majeure partie de l’histoire d’Israël.
Le gouvernement japonais a nommé Yoshinori Katori, attaché de presse au ministère des affaires étrangères, comme ambassadeur en Israël le 1er août 2006. Katori a précédemment servi de ministre en Corée du Sud et de directeur général du bureau consulaire d’affaires avant d’assumer le poste courant août 2005. En septembre 2008, Katori termina son poste en Israël et fut remplacé par l’Ambassadeur Haruhisa Takeuchi le 1er décembre 2008.
En juillet 2006, le Japon a annoncé un plan pour le « couloir de la paix pour la paix et la prospérité, » qui serait basé sur le développement économique et l’effort commun entre Israéliens et Palestiniens, plutôt que sur le contentieux continue du territoire. Shimon Peres a accordé beaucoup d’attention à ce projet pendant sa participation à une Conférence Internationale à New York en septembre 2006 qui était organisé par l’ancien Président des États-Unis Bill Clinton.
En juillet 2008, le gouvernement japonais a réitéré son soutien au plan lors des entretiens entre Israéliens et Palestiniens, et a invité les deux côtés à continuer de travailler vers l’accomplissement du plan. Le Japon a également annoncé son soutien au projet de parc agro-industriel près de Jéricho.
Il y a quatre ans (2016) Israël et le Japon ont signé un accord bilatéral de coopération économique. Depuis des années, les relations économiques entre l’Etat juif et le pays du Soleil Levant se sont affermies. Tokyo cherche en effet à renforcer ses compétences dans le domaine de la cyber-sécurité et dans les équipements médicaux.
Selon le directeur général du ministère israélien de l’Economie et de l’Industrie d’Israël, les capacités des industries nippones et israéliennes sont complémentaires, » chaque pays pouvant apporter à l’autre en termes d’échanges économiques ». En 2019 Israël a importé pour 1,3 milliards de dollars de marchandises du Japon et exporté pour 770 millions de dollars, essentiellement du matériel médical.
A SAVOIR.L es Relations entre Israël et le Japon ont commencé le 15 mai 1952 quand le Japon a reconnu Israël et qu’une légation israélienne s’est ouverte à Tokyo. En 1954, l’ambassadeur japonais en Turquie a assumé le rôle additionnel de ministre en Israël. En 1955, une légation japonaise avec un ministère plénipotentiaire s’est ouverte à Tel-Aviv. En 1963, les relations sont passées au niveau des ambassades, et le sont restées depuis. Les relations commerciales du Japon avec les nations arabes et l’Iran ont la priorité sur celles avec Israël.