La Bibliothèque nationale d’Israël possède près de cinq millions de documents, la plupart conservés en magasins. Elle est attributaire du dépôt légal de tous les documents publiés en Israël, et l’on estime qu’elle recueille effectivement environ 90 % de la production nationale .
Mais la bibliothèque se veut aussi une « bibliothèque nationale juive » et elle s’efforce donc d’acquérir et de conserver tout ce qui est relatif aux Juifs ou écrit par des Juifs :
- les Hebraica, ou documents écrits en caractères hébraïques ;
- les Judaica, ou documents en d’autres caractères portant sur les Juifs et le judaïsme.
La bibliothèque possède 12 500 manuscrits dont 10 000 en hébreu.
Parmi ses fonds particuliers, la Bibliothèque possède plus de 600 fonds particuliers, dont certains sont issus de dons de personnalités, dont Albert Einstein est l’un des plus célèbres. Elle détient aussi la collection de cartes d’Eran Laor, celle de Sidney Edelstein en histoire et philosophie des sciences, la collection Gershom Scholem, et une collection unique de manuscrits anciens de Moïse Maïmonide.
La Bibliothèque nationale s’est engagée dans d’importantes opérations de numérisation et propose une bibliothèque numérique accessible en ligne. Le programme de numérisation comprend des livres rares, des manuscrits du Talmud, des journaux anciens en hébreu ou en yiddish, des contrats de mariage juifs, ainsi qu’une partie des archives d’Einstein.